유전체학 썸네일형 리스트형 [제 12강] NGS library preparation (전처리과정) NGS는 DNA의 염기서열을 알기 위한 분석법으로 1세대 염기서열 분석법인 sanger sequencing에 비해 저렴하고 시간이 단축되는 혁신적인 기술이다. 오늘은 NGS (next generation sequencing) 차세대 염기서열 분석을 하기 위해 전처리 과정을 알아보고자 한다. DNA, RNA의 보고 싶은 부위(sequencing 하고자 하는)를 보기 위해 NGS 기기에 들어가기 전에 전처리과정이 필요하다. 우리가 보고 싶은 부위를 증폭을 하고, 기기에서 원하는 부위를 인식하기 위해 샘플 바코드를 붙여주는 작업이 필요하다. 이 과정은 sequencing 기기에 들어가기 전 처리 산물을 library라고 하며 이 과정을 library preparation(라이브러리 제작)이라 한다. 라이브러리.. 더보기 [제 9강] 마이크로바이옴의 기본 이론 안녕하세요 오늘은 인체 내에 존재하는 미생물들에 대해 얘기해보고자 합니다 눈에 안 보이는 미생물이 인간에게 얼마나 큰 영향을 끼치는지 알아볼게요~~! 마이크로바이옴이란 미생물+유전체(genome)로 인간 내에 있는 미생물 유전체를 말한다. microbiome=microbiota 인체 내에 ~1000종(species)의 박테리아가 있고, 인간의 유전자 100배 많은 유전자를 갖고 있어 제2의 유전체라고 부르기도 한다. 인간의 신체 중 장, 피부, 입 등 여러 부위에 존재하고(피부의 위치에 따라 조성에 차이가 있음), 마이크로바이옴은 태어난 후 3년 동안 새롭게 생성되면서 많은 변화가 일어나며 안정화를 찾아간다. 이렇게 초기에 형성된 마이크로바이옴 환경이 질병에 관여할 수 있고 또는 성인이 되어서도 큰 영향.. 더보기 [제 6강]GWAS - 전장 유전체 연관분석 과정(Genome wide association study) 과 SNP GWAS는 유전자와 표현형 사이의 연관성을 알기 위한 연구로, Genome wide 유전자 전체(유전체)의 association study 연관 분석 연구이다. 단어 뜻에서 보듯이 인간의 경우 23쌍의 모든 DNA를 분석하는 경우이고, EWAS(exome-wide association study)는 exome (단백질 코딩 가능한 지역-exon의 전체)을 분석하는 경우(intron 제외)이다. 이렇게 유전자 전체를 보게 되면 시간과 비용이 높아지므로, 효율성을 높이기 위해 보고자 하는 지역만 보는 연구도 많이 진행된다. GWAS를 하기 위해 필요한 유전자 염기서열 (genome sequence)은 1990-2003에 진행 한 '인간 유전체 프로젝트 (Human genome project - HGP)' 연.. 더보기 [제 5강]PCR(polymerase chain reaction)이란? DNA의 증폭 (amplification)방법 최근 코로나19로 대중들에게 PCR, PCR검사, DNA증폭이 익숙해졌다. 바이오에서 PCR은 기본 중 기본, 가장 중요한 기술이다. (PCR이 없다면 이만큼 발전도 못했을 것이다~!!) 일반적으로 PCR을 하는 이유는 아주 소량의 DNA를 대량으로 복제하는 기술로 바이오실험(분자생물학적), 질병의 진단검사, 법의학적 분석 등 널리 사용하고 있다. PCR의 뜻은 polymerase chain reaction 으로 polymerase는 polymer(여러개 연결) + -ase (효소) = 여러개 연결하는 합성 효소 (중합효소) polymerase라는 효소를 사용하여 chain reaction 연속적으로 반응한다는 뜻이다. PCR을 진행하기 위해 필요한 재료는 - DNA polymerase : DNA를 합성.. 더보기 [제 1장]인간 유전체 (human genome)에 대해서 안녕하세요 오늘은 인간 유전체 기본에 대해서 다루고자 한다~! 고고링 👍바로 시작👍 먼저 인간 유전체(human genome)란 사람의 유전자(gene) + 전체(~ome)으로 유전적 정보를 저장한 30억 쌍의 염기서열(base pair, bp) 전체 집합을 의미한다. 이때 30억쌍의 DNA 염기서열 이중나선 구조로 서로 상보적인 정보로 구성되어 있다. (더 자세한 DNA 기본 구조는 다음 포스팅에 진행~) 염색체의 작은 단위를 보자면, DNA + histone protein(히스톤 단백질)이 얽혀 염색질 형태로 나타나고, 이러한 염색체는 인간의 경우 23쌍으로 이루어져 있다. 이런 인간의 유전정보를 해독하기 위해 HGP(Human genome progect)라는 연구가 수년간 이루어졌으며, 이로인해 인.. 더보기 이전 1 다음
