ngs 썸네일형 리스트형 [제 12강] NGS library preparation (전처리과정) NGS는 DNA의 염기서열을 알기 위한 분석법으로 1세대 염기서열 분석법인 sanger sequencing에 비해 저렴하고 시간이 단축되는 혁신적인 기술이다. 오늘은 NGS (next generation sequencing) 차세대 염기서열 분석을 하기 위해 전처리 과정을 알아보고자 한다. DNA, RNA의 보고 싶은 부위(sequencing 하고자 하는)를 보기 위해 NGS 기기에 들어가기 전에 전처리과정이 필요하다. 우리가 보고 싶은 부위를 증폭을 하고, 기기에서 원하는 부위를 인식하기 위해 샘플 바코드를 붙여주는 작업이 필요하다. 이 과정은 sequencing 기기에 들어가기 전 처리 산물을 library라고 하며 이 과정을 library preparation(라이브러리 제작)이라 한다. 라이브러리.. 더보기 [제 11강] 마이크로바이옴(미생물)과 질병 마이크로바이옴의 기본은 제 9강 포스팅을 보면 이해가 쉽다 [제 9강] 마이크로바이옴의 기본 이론 인간 몸 속 구석구석 다양한 미생물이 살고있고 생태계를 이루고 있다. (건강한 사람의 경우 미생물이 다양하게 존재한다) 사람에게 질병이 발생하면 화학적 약처리나 식이변화로 인해 인간 체내에 사는 미생물들의 균형이 깨지면서 마이크로바이옴의 불균형(dysbiosis)가 발생하게 된다. 이런 특징을 이용하여 건강한 사람과 질병에 걸린 사람의 미생물 차이를 연구하면 마이크로바이옴의 구성에 따라 질병을 진단할 수 있는 바이오마커(biomarker)로 사용할 수 있게 된다. 대표적으로 마이크로바이옴의 불균형이 생기는 이유는 항생제의 투여이다. 미생물의 구성은 유익균+유해균으로 구성하는데 우리 인체에 좋은 영향을 주는 .. 더보기 [제 6강]GWAS - 전장 유전체 연관분석 과정(Genome wide association study) 과 SNP GWAS는 유전자와 표현형 사이의 연관성을 알기 위한 연구로, Genome wide 유전자 전체(유전체)의 association study 연관 분석 연구이다. 단어 뜻에서 보듯이 인간의 경우 23쌍의 모든 DNA를 분석하는 경우이고, EWAS(exome-wide association study)는 exome (단백질 코딩 가능한 지역-exon의 전체)을 분석하는 경우(intron 제외)이다. 이렇게 유전자 전체를 보게 되면 시간과 비용이 높아지므로, 효율성을 높이기 위해 보고자 하는 지역만 보는 연구도 많이 진행된다. GWAS를 하기 위해 필요한 유전자 염기서열 (genome sequence)은 1990-2003에 진행 한 '인간 유전체 프로젝트 (Human genome project - HGP)' 연.. 더보기 이전 1 다음